La sacristía tiene una dignidad especial, por ser como la antesala del lugar más sagrado. Precisamente eso significa su nombre: sacristía = cercano a lo sagrado. Es el lugar destinado para guardar los objetos y vestiduras sagradas, y donde ordinariamente se revisten los Ministros.

Según la tradición romana, hay dos sacristías: la sacristía mayor y la sacristía de trabajo. La sacristía mayor es como una capilla cercana al presbiterio, incluso con un altar y una imagen a reverenciar, en la cual se guarda la debida reverencia y silencio. La sacristía de trabajo es la sala donde se realizan las demás funciones de preparación a las celebraciones.

La sacristía mayor está detrás del retablo mayor. Tiene planta rectangular, con tres bóvedas de arista, separadas por arcos, de cuyo centro penden modernos candiles. Tiene piso de mosaico azul, y está pintado de azul desvanecido, salvo los arcos que son imitación cantera. En los espacios del muro del lado poniente tiene pinturas de poco valor artístico: al fondo norte el templo visto desde el jardín, cubierta en parte por el closet, pintada por Manuel Alvarez y Paulita Jiménez; y, cerca de la entrada, una vista del Valle desde la entrada por la Alameda, de Manuel Alvarez G. en 1970.

Tiene acceso al presbiterio detrás del altar; acceso a la Notaría Parroquial por una puerta en su extremo sur, y acceso a las casas por una puerta oriental lateral. Al centro está la gran cómoda. En la ventana arqueada del centro en la pared del lado oriente, está el antiguo vitral, restaurado en 1999, que representa un escudo con el logotipo de María, enmarcado por figuras ornamentales; predominan azules y amarillos, con algo de rosa, sobre el fondo blanco semitransparente. Enmarcado por la ventana, está el gran crucifijo, una imagen del Señor de la Misericordia traída por el P. Victoriano Villaseñor, que inspira devoción. Representa a Cristo muerto, tras la lanzada que traspasó su costado, con la cabeza inclinada a la derecha, apacible e invitando a pedir misericordia, con larga cabellera, corona de espinas dorada con las tres potencias, y cendal de brocados con galones y flecos de oro.

Falta pila de agua bendita para signarse al entrar y salir recordando el propio bautismo, así como piscina con desagüe a tierra para el agua de las purificaciones de vasos sagrados y purificadores. Junto a la puerta del presbiterio está el porta-ornamentos para revestirse. Toda lapared sur está ocupada por un closet, donde se guardan los utensilios litúrgicos.

En armario seguro se guardan, como caja fuerte, los cálices, copones, patenas, llave del sagrario, crismeras, relicarios, y todo lo que requiera mayor seguridad. Hay espacio para purificadores y corporales limpios y sucios, manutergios limpios y sucios, cerillos, mechas, vinajeras, las hostias y el vino de consagrar para uso inmediato. Y una estantería para la Biblia, el Evangeliario, los Leccionarios y Misales, los Rituales y demás materiales necesarios.

En el cajón superior derecho de la cómoda se encuentra la Agenda Litúrgica con indicaciones sobre las fiestas propias, la libreta de intenciones, tarjetitas para la intención de cada Misa, sobres para el estipendio; la mención del Santo Titular y del Obispo diocesano, las oraciones de preparación y acción de gracias. En los cajones de la gran cómoda se guardan los ornamentos, es decir, las dalmáticas, capas pluviales y antipendios en hilo metálico o rico bordado.

A la derecha del closet se cuelgan las casullas y a la izquierda las albas, las sotanas, cotas, estolones, y las vestiduras de los acólitos y ministros.

Hay lavabo, jabón y espejo para revisar el porte antes de salir, y un reloj. Los baños requieren acondicionarse.
Hay una mesa para colocar las cosas que se preparan. Además, está el brasero para encender las brasas, el soporte del incensario y la naveta, la cruz alta con su base, los ciriales con su base.