Los primeros colonizadores españoles se establecieron en la zona entre 1570 y 1580 lo único que se sabe es que en un documento fechado en 1595 el ameno valle es identificado con el nombre de "Estancia de San Nicolás.
Fue precisamente el 22 de diciembre de 1595 cuando el presidente de la Real Audiencia de Guadalajara, Don Santiago de Vera mercedó  al Arq. Don Francisco Casillas y Cabrera y su esposa Doña Francisca Gutiérrez de Escobar, "Una estacia de ganado mayor, 2 Caballerías de tierra y una cieneguita, en las tierras llamadas Estancia de San Nicolás, por lo que a partir de ese momento pasó a llamarse "Estancia de San Nicolás de los Casillas" o simplemente "Estancia de los Casillas"

Este caballero Don Francisco Casillas y Cabrera, Arquitecto de profesión era hijo de Don Martín Casillas quién tiempo atrás había presentado a la audencia un proyecto, para la construcción de la actual Catedral de Guadalajara; El proyecto resultó del agrado de la audiencia, del obispo y del rey por lo que fue encomendada la obra.

Después en la decada de 1850, después de la guerra de la independencia, los hermanos José y Nicolás Gonzalez  establecieron una hacienda llamada Venta de Pegueros . Sus hijos, Cenobio y Genaro, establecieron en la misma hacienda una posta de diligencias  que viajaban de Guadalajara a Aguascalientes y tenían; en un recorrido tocaban Lagos.
Al establecerse esta posta diligencias, le dio más vida y movimiento a aquel pequeño núcleo de población por el constante contacto con los viajeros que llegaban a hospedarse, lo que hizo que nuevas familias procedentes de rancherías cercanas fueran a avencindarse en las cercanías de la hacienda y posada.

Durante 1850 y a partir de la posta para diligencias, se inicia la construcción de lo que hoy es la Cabecera Municipal de Valle de Guadalupe.

En el año de 1879 se agregaron al poblado nuevos colonos. Mismo año  se avecindó en el lugar el Sr. José Pérez quien se echó a cuenta la tarea de construir una capilla, que una vez en servicio fue encomendada al padre Don Lino Carmen Martínez López.

En el año 1885, se trazaron las primeras calles, se construyeron las primeras escuelas  por iniciativa del Capellán Presbítero Lino Martínez López.

La Venta de Pegueros, por decreto N° 133 de fecha 30 de abril de 1885, cambió su nombre a Valle de Guadalupe y se erigió en Comisaría Municipal quedando comprendido en el Municipio de Jalostotitlán del 11° Cantón de Teocaltiche.

En 1903, por decreto del 1° de octubre pasa a formar parte del Municipio de Cañadas de Obregón.

Valle de Guadalupe se instituye como municipio el 31 de mayo de 1922 siendo su primer presidente Don J. Guadalupe Jordan Galván.
El decreto N° 2157 aprobado por el Congreso del Estado de Jalisco es publicado el 7 de julio de 1922.
 
 

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